上海交通大学医学院王牌专业有微电子学、信息安全、信息工程、软件工程(设3个专业方向)、临床医学、口腔医学、生物技术、机械工程及自动化等，以下是具体名单一览表，供大家参考，如有变动，以学校最新公布为准。
国家特色专业：微电子学、信息安全、信息工程、软件工程(设3个专业方向)、临床医学、口腔医学、生物技术、机械工程及自动化、信息工程、船舶与海洋工程、工业工程、医学检验、计算机科学与技术、生物医学工程、电气工程与自动化、土木工程、热能与动力工程、自动化、工程力学、生物工程、护理学、法学、电子科学与技术、环境科学与工程、化学工程与工艺、食品科学与工程、植物生物技术、核工程与核技术、材料科学与工程
教育部卓越工程师教育培养计划专业：材料科学与工程、机械工程及自动化、热能与动力工程、核工程与核技术、电气工程与自动化、信息工程、软件工程、土木工程、微电子科学与工程、自动化、信息安全、船舶与海洋工程、环境科学与工程、生物医学工程、生物工程
| 学院 | 专业 |
|---|---|
| 营养系 | 食品卫生与营养学 |
| 护理学院 | 护理学 |
| 公共卫生学院 | 预防医学 |
| 基础医学院 | 临床医学 生物医学科学 口腔医学 医学检验 护理学 营养学 预防医学 |
| 儿科学院 | 儿科学 |
| 检验系 | 医学检验 |
| 口腔医学院 | 临床医学（本博连读口腔医学方向） 口腔医学 |
| 临床医学院 | 临床医学（英语班） 临床医学 临床医学（本博连读法语班） 临床医学（本博连读） |
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