基础医学：基础医学专业学制短，侧重医学的基础理论、基本技能，主要研究的是病理即疾病的根源、发生发展机制以及如何预防与治疗，它以实验为主，学科内容与生物学、医学、药学多学科交叉。毕业主要在科研院所、医院从事研究、教学、实验工作。
临床医学：临床医学专业的主要学习课程模块包括基础医学和临床医学知识与技能等，毕业后经过规培合格，并通过临床执业医师资格考试，主要就业去向是综合性医院。
区别1：学习的侧重点不同
基础医学研究医学基础，比如解剖、生理、生化、微生物等等，临床医学就是我们去医院看见的那些门诊，内外科、五官科、眼科、皮肤科等等，两个专业都有临床的可能，但是临床专业的临床时间更长，因为他们还有一年起步的临床实习期。
区别2：培养的目的不同
基础医学专业的办学目的是为了培养具有深厚的人文底蕴、扎实的现代生命科学和医学理论基础、强烈创新意识、宽广国际视野和较强国际竞争力的医学教育和医学研究创新型人才。
临床医学专业的办学目的是为了培养具有医学岗位胜任能力的高级医学专门人才。:
区别3：就业方向不同
基础医学专业（本科层面）的就业方向主要是升学，从事医学研究。或者就业面向医院研究所、医药院校和医药公司等，从事基础医学各学科教学、科研研究及基础与临床相结合的医学实验研究工作。这个专业毕业能获得医学学士学位，但是不能报考国家职业医师资格。
临床医学专业的就业方向是工作于医院、医疗卫生科研和出版单位，高等医学院校，国家卫生行政部门等。这个专业（五年制）毕业获得医学学士学位，可报考职业医师资格证。
基础医学和临床医学都是好的专业，没有绝对的好坏之分，就业前景都较好。考生需要综合考虑自己的兴趣、目标、基础、实力、期望等因素，做出一个理性的选择。
至于哪个更好，这取决于个人的兴趣和职业规划：如果你想在将来当医生，那肯定是选择临床医学专业。如果你将来不想看病治人，只想从事医学研究，那么肯定选择基础医学专业。
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