个人建议：
第一选择：公办学校的闽台合作专业。第一，公办学校办学条件、环境和资源绝对比有太多优势，现在福建省的二本学校都在争取申请硕士校，投入大量人力物力和资金，提高办学实力。高层次人才引进、好设备购置和教室实验室等环境巨大改善！更主要的是，国家大力发展高等教育，抓教学质量的高压下，这些学校的领导们不敢掉以轻心，恪尽职守抓质量。所以公办的学习氛围、诚信度和负责任程度绝对是非常高的。
第二选择：民办自己兴趣的专业，未来就业前景较好的专业。而且看看民办学校办学主体是谁，社会的口碑如何。
请问是本科还是专科？
1.本科肯定是独立院校好啦，例如：厦门大学嘉庚学院 就是 厦门大学 的独立学院。
民办我还真不好说，有些民办也很有名气的，例如 上海杉达
2.专科若想专升本就选可以直升的院校，例如 厦门理工学院 的专科拉~
若是出来直接工作就挑好专业拉~
3.【以下个人意见仅供参考哦~】是我就首选独立院校拉，实力应该比较强吧。闽台合作只是多了到台湾实习或交流的机会，钱也要是重点考虑的。本科、专科都有闽台合作。总之都是为了“钱途”，看看那个对自己更有利哈~
不知道你是不是说厦门理工和闽江学院的闽台合作，我是理工闽台合作大二生。
一般闽台合作的专业分数相对低一点，学费也很高（我的专业每年就一万多），学校会安排大三一年去台湾的高校交换学习（理工是这样）。不过并不是很好的学校，因为政治环境什么的，能谈下来的只有排名一般的私立，其他的差别就没有了，与别的专业毕业证什么的一样的。说白了就是多一个去台湾的经历。
希望这些对你有帮助^^
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