1、三本院校的教学队伍弱，三本类学校的研究能力为零。相比较一本和二本来说师资力量较差，没有研究生院，更没有博士点。三本学校的教师队伍里，很大一部分是本科毕业生。在二本学校里，这种现象不可能出现。最低的教师学历要求都已经是硕士学位。
2、三本院校收费较高。但是三本较高的学费上缴并不能带来优质的教学硬件设施，也很难带来优秀的教师资源。相比较一本和二本3000到5000的学费着实是昂贵很多。
3、三本院校的学生毕业后相比较一本和二本毕业的学生来说很难找到好的工作，平均的工资待遇也相比较来说是相差甚远。
4、三本毕业的学生的社会地位普遍偏低。三本学校毕业的学生进入社会后普遍感到归属感较低，相比较一本二本的学生没有自信，参加社会活动时，缺少必要的能力和信心。专业技能以及学习能力与一本二本的学生相比确实有着较大的差距。这也是三本和二本的区别。
二本和三本区别不大，主要就是学费上的区别，三本学费很高，三本一般都是民办院校，而在大部分同学和家长的思维中，民办就是差，但是数据表明，世界一流大学都是民办，包括国内南开大学，那也是民办后来升了211，数据表明，同级内，民办的教学质量和就业满意率要凌驾于公办之上，毕竟那么贵的学费不能白花。
能上二本最好了，但一定要考虑好，如果考虑学费问题的话，还是建议考二本，三本学费太高了，三本和专科就区别比较大了，毕竟一个本科毕业证，一个专科毕业证，而具体走三本还是走专科，看三本学费和考研率，能接受就走三本，不能接受就凭借自己的能力去一个有专科的本科院校，利用其本科学习氛围和师资力量，专升本时候再创辉煌
二本院校和三本院校区别很大。主要区别是二本为公办、三本院校为民办院校。
普通二本大学指的是录取批次放在第二批的大学，每个省的情况都不一样。比如山东师范大学，在外省是放在普通二本批次录取的，但是在山东本省就是一本（包括重点本、普通1本)录取。但总体上说，一本大学（包括重点本、普通1本)大都是部委直属大学或者“211工程”大学，而普通二本大学大多为省属大学或者非“211工程”大学，二者在师资、硬件等方面还是有一定差距的。这也是为什么大家都追捧一本大学的主要原因。相对来说，考上一本大学（包括重点本、普通1本)的学生毕竟是少数，更多的同学读的是普通二本、普通三本大学。纵观全国的高考形势，重点大学停止扩招而高考报名人数不断攀升，预示着普通二本、普通三本大学将成为高考战场上的热点。 第三批本科 即三本高考中本科按录取批次划分为三个批次，一本为第一批次、二本为第二批次、三本为第三批次，每年三本线有考生总成绩而有所不同。也是指三本院校，一般“三本”本科高校包括：
1、独立学院==独立二级学院（公、民合办，民企出资，属于民办范畴）、2、民办普通本科高校。（私办、私人出资）、3、合作办学本科高校。（属于民办范畴）。三本高校：具有“校园独立、招生独立、财务独立，部分师资力量与教学设施等与校本部共享”等特点。三本院校的学费较高。 考生在修完大学四年课程，在三本院校顺利毕业之后，可以取得“本科毕业证书”和“学士学位证书”等两个证书，毕业证和学位证都是独立学院的证书，并以独立学院名称具印。从全国范围看，独立学院自1999年6月诞生，是指普通本科高校依据相关规定，是为了贯彻落实教育部八号文件精神，按照新的机制和模式举办的本科层次的二级学院。独立学院的产生，主要有以下几种方式：国办院校结合企业资本联合举办、民办大学挂靠改制和国办大学独立兴建这三种方式。
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一、创立的主体不同
1、民办高校创立主体是企业事业组织、社会团体及其他社会组织和公民个人。
2、公办高校创立主体是国家政府或地方政府资助创立维持的高等院校。
二、资金的来源不同
公办高校资金的来源是国家或者地方政府，民办高资金是利用非国家财政性教育经费，面向社会举办的高等学校及其他教育机构，其办学层次分专科和本科。
三、学费不同和办学的要求不同
民办高校的学费是公立大学的三到四倍。国家鼓励社会力量举办实施义务教育的教育机构作为国家实施义务教育的补充。国家严格控制社会力量举办高等教育机构。国家对社会力量办学实行办学许可证制度。各级教育行政部门按照规定的审批权限，对批准设立的教育机构发给办学许可证。
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