民办本科毕业证有很多种，其中有民办本科自己发的本科毕业证，没有通过教育认证，这种人事局是不收也不承认的。
如果你通过民办高校组织参加自考、成人高考、远程教育而获得本科毕业证，这些都是教育部承认的，人事部门也会承认，你需要把毕业生登记表上交给人事部门。
首先预祝您工作顺利！可以肯定的是 档案肯定是会收的但是：你毕业后，到你学校去，把档案拿出来，然后去人才市场，挂在那，就行了，好象要交点钱，是按多少钱一个月来收的。
建议别放那去，浪费钱，现在档案基本没有用了，放人才只是说图个工龄，但是现在已经不流行这个了。你问问你单位上的就知道了，可以参考他们的意见，不用到这里来问了！
档案可以放进人才交流中心的，但是要收管理费。
民办大学的毕业证书虽然没国立大学的好，但是找私人企业的工作也是可以的（毕竟这些公司是重能力)。托孤要想进国有企业或是国家机关单位的话那就不行（这类的工作就是只要你有学历就OK了）。
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