一、最主要的区别:
区别一：
民办高校是按照民办教育促进法设立的，而独立学院是教育部行政规章设立的。独立学院一定是本科，而民办高校专本科都有。
区别二：
独立学院的举办方一定是普通高校，合作方是社会力量，而民办则只有社会力量作为举办者，这是区分两者的最简单的一点。因此，独立学院一般设在某个大学名下。比如山西大学商务学院，海南大学三亚学院等。
这些学院，可能和挂名的大学同在一个校园，也可能有师资等方面的共享和交流，而民办学院没有这方面的优势。
区别三：
民办就是有自己的校名，自己组织机构，自己的师资，自己的校园，自己独立颁发毕业证书。独立学院的毕业生将获得获国家承认的学历证书。与学校本部毕业证书不同的是，其毕业证书上加盖的是某某大学某某学院印章，而学校本部学生的毕业证书只盖有学校校名印章。
区别四：
独立学院的专业是从当时母校中相对较热、较强的专业中建立设置的。独立学院母校名气大的生源会好一些，当然录取分数就会高一些。而民办院校的特色专业生源也会好一些，录取分数也会高一些。
区别五：
独立学院可以毕业时，如果成绩好可以推荐使用挂名院校的毕业证。这种毕业证可能也略有差别。比如北大本校毕业生领取红色的毕业证，而独立学院的北大毕业证是蓝色的。
二、独立学院分为两大类：
是实施本科以上学历教育的普通高等学校;
二是由国家机构以外的社会组织或者个人合作办学，利用非国家财政性经费举办的实施本科学历教育的高等院校。
扩展资料：
独立学院是民办高等教育的重要组成部分，属于公益性事业，依法享有民办教育促进法、民办教育促进法实施条例规定的各项奖励与扶持政策；由省、自治区、直辖市人民*教育行政部门主管本行政区域内的独立学院工作。截至2017年12月25日，全国共有独立学院260所。
民办高校的学费是公立大学的三到四倍。国家鼓励社会力量举办实施义务教育的教育机构作为国家实施义务教育的补充。国家严格控制社会力量举办高等教育机构。国家对社会力量办学实行办学许可证制度。各级教育行政部门按照规定的审批权限，对批准设立的教育机构发给办学许可证 。
参考资料： 人民网-独立学院变身民办高校 为何真“独立”
百度百科-独立学院
百度百科-民办高校
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