福建工程学院有52个本科专业，设机械与汽车工程学院、材料科学与工程学院、信息科学与工程学院、土木工程学院、建筑与城乡规划学院、管理学院、生态环境与城市建设学院、交通运输学院、人文学院、法学院、数理学院、设计学院、思想政治理论课教研部、体育教研部等14个院系（部）及继续教育学院。
建筑学或规划会比较好点，还有机电也还可以，但是建筑学的分数估计在本一分数左右，会计的话读了三年貌似没听过，这所学校主要是以工科为主，苍山校区的那几个建筑类的专业比较好点，但是学校合并后，因为领导是以前那边的把苍山校区建筑类的给耽搁了，没怎么发展。
1土木工程系
2建筑与规划系
3机械设计制造及其自动化系
4电子信息与电气工程系
5材料科学与工程系
6环境与设备工程系
7经济管理系
8工程管理系
9数理系
10计算机与信息科学系
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