在维普和万方查重系统中维普的查重率高。作为和知网齐名的查重系统，维普和万方也是一些高校或个人会选择的查重系统，但维普的查重数据库要比万方大，系统算法也高级一点，所以维普查重的精确度要高于万方。
维普查重系统收录的数据库为国内外各类科学期刊，比如知名的《自然》、《生物》和、《细胞》这种正规发表的期刊杂志，所以需要发表到期刊上的论文一般选择维普进行查重；万方查重系统主要收录的是版权期刊和各大研究所等的论文数据，数据库相对而言要小一些。
维普查重系统根据论文的字数，每查重一次论文的花费在30元到100元左右；万方查重系统的价钱就十分低了，一般在几元左右，长篇论文花费才有可能要十几元。
维普查重系统主要运用的是聚类算法，即是用聚类算法将论文进行和维普查重系统数据库进行比对，然后设定一个阈值，如果连续相似的内容超过设定的阈值的时候，就会被识别为抄袭，并且被标记成红色；万方查重系统是利用ImageNet数据模型，然后对论文内容进行比对，优点是查重快，但准确度较低。
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