1野生动植物保护与利用
该学科是省级重点学科，涵盖生物系“生物科学”、“环境科学”、“生物技术”和“园林”四个本科专业。本学科是西华师大申报博士点重点建设学科之一。
2动物学
该学科被四川省教委评列为省级重点学科，下设有脊椎动物实验室、无脊椎动物实验室、动物生态实验室、动物分类实验室、动物分子生物学实验室、动物地理信息系统实验室、水生动物实验室、珍稀动物繁殖野化实验室、无脊椎动物标本室、脊椎动物标本室。其中脊椎动物标本室的标本种类占四川省脊椎动物总物种数的90%，拥有鱼类标15000余号，两栖类1900余号，爬行类700余号，鸟类6600余号，兽类4000余号，在全国高校中都名列前茅。
3政治学理论
政治学理论是西华师范大学的重点学科之一，也是省级学科，正在争取获得政治学理论博士学位授权点。
4马克思主义基本原理
2008年被批准为四川省重点学科，1998年本学科获得马克思主义理论与思想政治教育硕士点，是四川省属高校同类学科中最早的硕士点，2006年成功申报马克思主义理论一级学科硕士授权点，是目前四川省属高校中唯一一个马克思主义理论一级学科硕士授权单位，正在争取博士学位授权点。
5历史文献学
该学科为省级学科，2002年我校正式组建了“历史文献学”点，并获得国家学位办的批准，并于次年开始招生。
6其他还有中国古代文学和有机化学两门省级学科。
国家级特色专业（7个）：汉语言文学、生物科学、 思想政治教育、物理学、教育学、体育教育、地理科学
省级特色专业（16个）：教育学、汉语言文学、历史学、化学、音乐学、体育教育、生物技术、生物科学、教育技术学、思想政治教育、环境科学、地理科学、心理学、物理学、应用电子技术教育、计算机科学与技术等
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