1、厦门大学：
根据2017年全国第四轮学科评估结果，该校最好的学科为海洋科学，其次为应用经济学、 化学、统计学、工商管理。
2、福建师范大学：
根据2017年全国第四轮学科评估结果，该校最好的学科为马克思主义理论、体育学、音乐 与舞蹈学，其次为中国语言文学、地理学。
3、福州大学：
根据2017年全国第四轮学科评估结果，该校最好的学科为化学，其次为管理科学与工程、 工商管理。
4、福建农林大学：
根据2017年全国第四轮学科评估结果，该校最好的学科为生态学、风景园林学、植物保 护、林学，其次为生物学、食品科学与工程。
5、华侨大学：
学校学科实力稳步提升，现有国家重点学科、省部级重点学科41个，福建省高峰高原学科 17个，工程学、材料科学、化学3个学科进入ESI全球排名前1%。
6、福建医科大学：
根据国际权威机构统计，自2009年始临床医学学科进入ESI排名前1%。
7、福建中医药大学：
根据2017年全国第四轮学科评估结果，该校最好的学科为中西医结合，其次为中医学。
8、福建工程学院：
该校国家级特色专业有土木工程、工程造价、电气工程及其自动化。
9、集美大学：
根据2017年全国第四轮学科评估结果，该校最好的学科为食品科学与工程、水产，其次为 体育学、数学。
10、闽江学院：
该校进入ESI排名全球前1%的学科领域有一般社会科学、工程科学。
福州的大学排名如下：
1、福州大学 ；
2、福建师范大学；
3、福建医科大学；
4、福建农林大学；
5、福建中医药大学；
6、闽江学院；
7、福建工程学院；
8、福建警察学院；
9、福建江夏学院；
10、福建技术师范学院；
11、福建商学院；
福州大学，简称福大，位于福建省福州市，创建于1958年，是国家“双一流”建设高校，国家“211工程”建设高校，国家教育部、国家国防科技工业局与福建省人民政府共建高校，福建省三所重点建设的高水平大学之一。
福建省一流大学建设高校，入选国家建设高水平大学公派研究生项目、教育部首批“卓越工程师教育培养计划”高校、新工科研究与实践项目、数据中国“百校工程”项目、国家”111计划”、“高校国际化示范学院推进计划”。
国家级大学生创新创业训练计划、全国首批深化创新创业教育改革示范高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校、全国专业学位研究生教育综合改革试点单位、国家集成电路人才培养基地、首批高等学校科技成果转化和技术转移基地、高校国家知识产权信息服务中心。
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