985大学有39所。首批985工程大学有清华大学，北京大学，复旦大学，上海交通大学，哈尔滨工业大学，南京大学，浙江大学，中国科技大学，西安交通大学。
“985工程”一期建设率先在北京大学和清华大学开始实施。2004年，根据《2003—2007年教育振兴行动计划》，教育部、财政部印发《教育部、财政部关于继续实施“985工程”建设项目的意见》，启动二期建设。
2019年11月28日，教育部官网发布声明：已将“211工程”和“985工程”等重点建设项目统筹为“双一流”建设。
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