南京农业大学2022年在全国本科院校排名第61位，南京农业大学前身可溯源至1902年三江师范学堂农学博物科和1914年私立金陵大学农科。
南京农业大学2022年在全国本科院校排名第61位，本省大学排名第9位。
| 2022大学排名 | 学校名称 | 省市 | 2022本省排名 | 类型 |
| 61 | 南京农业大学 | 江苏 | 9 | 农林 |
南京农业大学2021年全国本科大学排名第60位，2020年排名第59位，2019年排名第64位。
| 年份 | 排名 | 所在地排名 |
| 2021 | 60 | 江苏（9） |
| 2020 | 59 | 江苏（9） |
| 2019 | 64 | 江苏（9） |
| 2018 | 59 | 江苏（8） |
| 2017 | 54 | 江苏（7） |
| 2016 | 49 | 江苏（5） |
| 2015 | 49 | 江苏（5） |
南京农业大学拥有一级学科国家重点学科4个，二级学科国家重点学科3个，国家重点培育学科1个。在第四轮全国一级学科评估中，作物学、农业资源与环境、植物保护、农林经济管理4个学科获评A+，公共管理、食品科学与工程、园艺学3个学科获评A类。有8个学科进入江苏高校优势学科建设工程。
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