哈尔滨工程大学是211大学，但不是985大学。全国共有115所211大学，39所985大学，其中黑龙江有4所211大学，1所985大学，目前985和211大学建设已经统筹为双一流大学建设。
哈尔滨工程大学1978年被国务院确定为全国重点大学；是首批具有博士、硕士学位授予权单位，首批“211工程”重点建设高校；
2002年，获批建立研究生院；
2011年，成为国家“985工程”优势学科创新平台项目建设高校；
2017年，进入国家“双一流”建设行列；是国家“三海一核”（船舶工业、海军装备、海洋开发、核能应用）领域重要的人才培养和科学研究基地。
985和211的区别是提出时间、建设目标、国家和地方扶植上面不同。不同时期提出的对中国教育指定的目标，211是1995年提出的面向21世纪，而985是1985年提出的建设世界先进水平一流大学。
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