在2022年南通市大学最新排名中，南通大学排名第一位，南通大学杏林学院排名第二位，南通理工学院排名第三位，南通职业大学排名第四位，江苏航运职业技术学院排名第五位。
| 排名 | 学校名称 | 星级排名 | 办学层次 |
| 1 | 南通大学 | 3★ | 区域一流大学 |
| 2 | 南通大学杏林学院 | 2★ | 区域高水平应用型大学 |
| 3 | 南通理工学院 | 1★ | 区域知名应用型大学 |
| 4 | 南通职业大学 | 4★ | 中国高水平高职院校 |
| 5 | 江苏航运职业技术学院 | 3★ | 区域一流高职院校 |
| 6 | 南通师范高等专科学校 | 3★ | 区域一流高职院校 |
| 7 | 江苏商贸职业学院 | 2★ | 区域高水平高职院校 |
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