南京的一本院校有：
南京大学
东南大学
南京航空航天大学
南京理工大学
南京工业大学
南京邮电大学
河海大学
南京林业大学
南京信息工程大学
南京农业大学
南京医科大学
中国药科大学
南京师范大学
南京中医药大学
南京财经大学
南京一本院校中211院校有：南京大学、东南大学、南京航空航天大学、南京理工大学、河海大学、南京农业大学、中国药科大学、南京师范大学。
南京一本院校中985院校有：南京大学、东南大学。
江苏一本大学有:东南大学、南京农业大学、河海大学、南京师范大学、南京理工大学、苏州大学、南京航空航天大学、江南大学、南京工业大学、扬州大学等。
东南大学（Southeast University），简称“东大”，本部位于南京，是中华人民共和国教育部直属全国重点大学，中央直管副部级建制，是国家“双一流”、“985工程”、“211工程”重点建设高校，入选“珠峰计划”。
“强基计划”、“2011计划”、“111计划”、卓越工程师教育培养计划、卓越医生教育培养计划、学位授权自主审核单位。
首批未来技术学院建设高校，为“建筑老八校”、卓越大学联盟、长三角可持续发展大学联盟、中英大学工程教育与研究联盟、中俄工科大学联盟、碳中和世界大学联盟成员。
东南大学肇始于1902年创建的三江师范学堂，后历经两江师范学堂、南京高等师范学校、国立东南大学、国立中央大学等重要历史时期。
1952年全国高校院系调整，学校文理等科迁出，以原国立中央大学工学院为主体，先后并入复旦大学、交通大学、浙江大学、金陵大学等校的有关系科。
在国立中央大学本部原址（今东南大学四牌楼校区）建立南京工学院，1988年恢复东南大学校名。2000年与原南京铁道医学院、南京交通高等专科学校、南京地质学校合并组建新的东南大学。
截至2023年3月，学校建有四牌楼、九龙湖、丁家桥等校区，总占地面积5888亩；设有34个院系，开设87个本科专业。
拥有39个一级学科博士点、50个一级学科硕士点；有12个学科入选第二轮“双一流”建设学科名单、5个学科在第四轮学科评估中获得A+。
有全日制在校生38419人，其中本科生16785人，研究生21634人，在校留学生1994人；有专任教师3300人。
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