牡丹江专科学校有牡丹江大学、黑龙江林业职业技术学院、黑龙江农业经济职业学院。
牡丹江大学（Mudanjiang University），坐落在黑龙江省牡丹江市，始建于1983年，是经黑龙江省人民政府批准，教育部备案，由牡丹江市人民政府主办的一所综合类全日制普通高等专科学校。
1983年7月，黑龙江省高教局批复同意成立牡丹江大学。1984年8月，牡丹江大学与市行政干校合并。1985年8月，学校新教学楼峻工，有了自己的校舍，告别了委托办学、借地办学、联合办学的历史。
1986年6月，牡丹江市政府决定将市直机关职工大学并入牡丹江大学。1991年5月，牡丹江市广播电视大学并入牡丹江大学 。2012年11月15日，牡丹江大学申请升格为应用型本科院校被黑龙江省省政府批准列入国家“十二五”计划 。2019年8月5日，牡丹江大学医护学院成立暨揭牌仪式在牡丹江市卫生学校举行，该学院的成立结束了牡丹江无医护高等专科的历史。
牡丹江职工大学现在正式更名为牡丹江师范大学，是一所以培养高素质应用型人才和传播社会主义精神文明为主的教育机构，肩负着培养社会主义核心价值观的使命和责任，拥有二级学科硕士学位授予权和博士学位授予权。学校现有本科专业51个，其中文科专业19个，理科专业32个；硕士学位授权一级学科23个，二级学科44个，博士学位授权一级学科20个，二级学科36个。学校目前有教职工1900多人，其中专任教职工1300多人，具有高级职称的教师400多人，教授、副教授占比60?(MISSING)上。学校拥有学士学位学生9000余人，研究生1000余人。
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