2004年5月,经国家教育部批准,原南通医学院、南通工学院、南通师范学院合并组建南通大学。南通大学现有四个校区，分别是主校区、启秀校区、文峰校区和钟秀校区，占地2286.77亩，校舍总面积61.93万平方米。
根据2014年6月学校官网显示，南通大学设有94个本科专业，25个学院、1个独立学院、1个国际教育学院和1个继续教育学院，拥有1所近百年历史的大型综合三级甲等附属医院。
最好的学科有：
国家重点学科培育建设点（1个）：人体解剖与组织胚胎学
省高校优势学科（2个）：基础医学、新能源及其装备
省一级学科重点学科（6个）：基础医学、信息与通信工程、临床医学、中国语言文学、特种医学、美术学
省重点学科（6个）：人体解剖与组织胚胎学、 中国古代文学、通信与信息系统、航空、航天与航海医学、内科学、外科学
省重点建设学科（3个）：机械设计及理论、控制理论与控制工程、眼科学
省优秀学科梯队（5个）：人体解剖与组织胚胎学、中国古代文学、机械设计及理论、通信与信息系统、骨外科
省医学重点学科（3个）：手外科、眼科学、实验诊断学
省临床医学中心（1个）：手外科
省临床医学重点专科（10个）：血液内科、消化内科、心血管内科、普外科、骨外科、眼科、医学检验神经内科 、皮肤性病学、肾内科。
江苏南通的大学有南通大学、南通高等师范学院、南通纺织职业技术学院。
一、南通大学。
1、南通大学是国家“卓越医生教育培养计划”“卓越教师培养计划”试点高校。学校坐落于江苏省南通市，校训为“祈通中西，力求精进”。
2、南通大学规模结构合理、学科门类齐全、教学质量优秀、办学效益明显的地方综合性大学。南通大学比较好就业，学校很好，学校有4个校区，主校区地理位置在市区，所以出行很方便，交通便利，学生就业前景挺好的。
3、南通大学学校始建于1912年，源自近代著名实业家、教育家张謇先生创办的私立南通医学专门学校和南通纺织专门学校。
4、截至2022年，南通大学在中国管理科学研究院《2022中国大学评价》中列第106位，ESI中国高校综合排名列第114位；在软科2022中国大学排名第169名。
二、南通高等师范学院。
1、南通高等师范学校是一所以培养专科程度小学（含学前）师资为主要任务的市属全日制高等校，业务归口江苏教育学院，同时增挂江苏教育学院南通分院校牌。
2、南通高等师范学校是我国第一所独立设置的师范学校，第一所举办五年制师范教育的学校，是同类学校中唯一的骨干教师国家级培训基地。
3、南通高等师范学校办学曾获国家教育部首批表彰，教育录像曾作为我国中等教育的典型在国际教育大会上交流放映。
4、南通高等师范学校连续 20 年被评为江苏省文明单位，还先后荣获“全国语言文字工作先进集体”、“江苏省教育科研先进集体”，“江苏省德育先进集体”和“江苏省科技特色学校”“江苏省素质教育基地”等光荣称号。
三、南通纺织职业技术学院。
1、江苏工程职业技术学院是国家示范性高职学院，江苏省高水平高职院校建设单位。
2、江苏工程职业技术学院是我国第一所纺织专科学校。校训为“忠实不欺、力求精进”。
3、江苏工程职业技术学院现设有纺织服装学院、机电工程学院、商学院（社会管理工程学院）、艺术设计学院、建筑工程学院、航空与交通工程学院、信息工程学院等7个二级学院和素质教学部，设置42个专业（方向）。
4、学校着力打造一支师德高尚、理念先进、教学水平高、实践教学能力强、专兼结合、结构合理的师资队伍。
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