院系设置
南京大学历史上设立了中国第一个文理学院、商学院，创立了国内最早的生物系、地学系、气象系、心理学系、西洋文学系、建筑系、航空系、体育科、艺术科以及工商管理、金融、会计、国际贸易等科系。 文学院 文学系 语言学系 文献学系 戏剧影视艺术系 大学语文部 哲学系（宗教学系） 历史学系 理学院 数学系[1] 天文学系 物理学院 现代物理系 物理学系 光电科学系 声科学与工程系 基础物理教学中心 电子科学与工程学院 电子工程系 微电子与光电子学系 信息电子学系 通信工程系 电子电工实验教学中心 微制造与集成工艺中心 现代工程与应用科学学院 材料科学与工程系 地球科学与工程学院 地球科学系 水科学系 地质工程与信息技术系 大气科学学院 气象学系 大气物理学系 地理与海洋科学学院国土资源与旅游学系 城市与区域规划系 地理信息科学系 海岸海洋科学系 计算机科学与技术系 新闻传播学院 商学院[2] 经济学院（经济学系 国际经济与贸易系 金融与保险学系 产业经济学系 人口研究所） 管理学院 （工商管理系 会计学系 电子商务系 市场营销系 人力资源管理学系） 外国语学院[3] 英语系 俄语系 日语系 德语系 法语系 西班牙语系 国际商务系 朝鲜语专业 法学院 生命科学学院[4] 政府管理学院思想政治理论教研部 政治学系 行政管理学系 劳动人事与社会保障系 信息管理系 社会学院[5] 社会学系 心理学系 社会工作与社会政策系 化学化工学院 环境学院 医学院[6] 软件学院海外教育学院 对外汉语 工程管理学院 教育研究院 匡亚明学院（基础学科教育学院） 大学外语部 体育部[7] 文化艺术教育中心 模式动物研究所 中美文化研究中心 建筑与城市规划学院[8] 建筑系 城市规划与设计系 国际学院 国防生 美术研究院金陵学院
南京大学最好的学院是南大天文系学院。南大天文系学院在全国的专业排名是排在第一位的，这个是全国公认的，南大天文学院成立于2011年3月，是中国高等院校历史最悠久，培养人才最多的天文学专业院系，是中国天文学顶尖人才的摇篮，拥有中国唯一的天文学一级重点学科，所以南京大学最好的学院是南大天文系学院。
文学院 中国语言文学 戏曲戏剧学文艺学*
哲学系 （宗教学系） 马克思主义哲学 马克思主义哲学*宗教学
历史学系 世界史 中国近现代史
法学院 经济法学
商学院 政治经济学
企业管理 世界经济会计学
外国语学院 英语语言文学 法语语言文学
公共管理学院 政治学理论
社会学系 社会学 社会学*
信息管理系 情报学 情报学*
数学系 数学 应用数学*
物理学系 物理学 微电子学与固体电子学
电子科学与工程系
天文学系 天文学
化学化工学院 化学
计算机科学与技术系 计算机科学与技术 计算机应用技术*
材料科学与工程系 材料物理与化学 材料物理与化学*
环境学院 环境科学 环境工程
地球科学系 地质学 地球化学*
水文学及水资源
大气科学系 气象学
地理与海洋科学学院 自然地理学 海洋地质 地图学与地理信息系统 土地利用与规划
生命科学学院 生物学 生理学*
医学院 外科学（普外） 内科学
工程管理学院
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