牡丹江师范学院包括专业有：马克思主义理论、中国语言文学、物理学、生物学、体育学、外国语言文学、数学、化学、数据科学与大数据技术、计算机科学与技术、电子信息科学与工程、电气工程及其自动化、数学与应用数学专业（师范）等专业。
牡丹江师范学院设有文学院、法学院、马克思主义学院、数学科学学院、物理与电子工程学院、教育科学学院、历史与文化学院、经济与管理学院、生命科学与技术学院、化学化工学院、西方语言学院、东方语言学院、应用英语学院、体育科学学院、计算机与信息技术学院、美术与设计学院、音乐与舞蹈学院和研究生学院18个二级学院，以及国际教育学院、继续教育学院
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