有区别，山西医科大学校本部这边一本A类是七年制本硕连读的，一本B类是临床和口腔的，二本A类是其他剩下的专业，有预防，影响，麻醉，儿科，法医等等，二本在校本部没有临床专业。你说的二本A类的临床专业，要是有的话也是在分校区，比如晋祠学院，汾阳学院之类，毕业证上面到时候就会写“山西医科大学”或是“山西医科大学汾阳学院”。学的课程本科都是一样的，本硕连读的不太一样。
山西医科大学介绍：
山西医科大学的前身是山西医学传习所，创建于1919年。学校现有两个校区，占地1398亩，建筑面积50余万平方米；固定资产总值5.67亿元，其中教学科研仪器设备值2.5亿元；纸质图书135万册。位于山西省太原市新建南路56号的老校区是学校的科学研究中心。
二本，山西医科大学汾阳学院在山西属于本科第二批次招生，所以通常认为山西医科大学汾阳学院是一所二本大学。山西医科大学汾阳学院简称“山医汾院”，是一所由山西省教育厅主管、具有独立法人资格的山西医科大学的二级学院。
汾阳医学院是二本。汾阳医学院一般指山西医科大学汾阳学院。山西医科大学汾阳学院是一所由山西省教育厅主管，具有独立法人资格、副厅级建制的院校，是山西医科大学的二级学院。
山西医科大学汾阳学院介绍
山西医科大学汾阳学院是山西医科大学下属的二级学院之一，与公共卫生学院、基础医学院等二级学院是同一级别，但又是相对独立的，但不是三本独立院校。
山西医科大学汾阳学院开设有本科专业和专科专业，对于本科专业来说，在山西省内，临床医学专业是一本招生，其他专业是二本招生。汾阳学院不在三本批次招生。
汾阳学院是一所多专业、多学制、多层次的高等医学院校。设置有临床医学、护理学、口腔医学、医学影像学、医学检验技术、眼视光学、康复治疗学、医学实验技术8个本科专业和临床医学、护理、助产、卫生信息管理、药品经营与管理、健康管理等6个专科专业及护理（老年护理方向）1个专科专业分流方向；有硕士、本科、专科三个办学层次；有普通高等教育、高职高专教育和成人高等教育等多种办学形式。目前，学院有护理学、人体解剖学与组织胚胎学、生物化学与分子生物学、生理学、病理学与病理生理学、临床检验诊断学、药理学、内科学、外科学、神经病学、耳鼻咽喉科学和公共卫生等12个学科招收硕士研究生。
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