新竹市大学有台湾清华大学、台湾交通大学、台湾艺术大学、台湾中华大学、台湾玄奘大学、台湾元培科技大学。
1、台湾清华大学
台湾清华大学始建于1911年，位于中华，人民共和国台湾省新竹市，是公立普通高等院校。台湾清华大学是环太平洋大学联盟、中欧商校联盟、东亚研究型大学协会成员高校。
2、台湾交通大学
台湾交通大学位于中华人民共和国台湾省新竹市，是台湾顶尖研究型重点大学之一， 与中国大陆四所交大共同联合成立交通大学校友总会。
3、台湾艺术大学
台湾艺术大学成立于1955年10月31日， 位于台湾省新北市板桥区浮洲地区,前身为艺术学校及后来的台湾艺术专科学校。
4、台湾中华大学
台湾中华大学位于台湾省新竹市香山区，创立于1990年，前身为中华工学院。
5、台湾玄奘大学
台湾玄奘大学位于中国台湾地区新竹市香山区,是- -所成立于1997年的私立大学, 前身为玄奘人文社会学院。
6、台湾元培科技大学
元培医事科技大学位于台湾新竹，1962年创校人蔡炳坤先生自欧美考察八十八天後，因深感核子医学研究与发展过於缓慢、医事科技专才相对不足，创校兴学的理想於此发端，并展开筹划。
一、台湾大学（NationalTaiwanUniversity），简称台大（NTU），成立于1928年，是中国台湾省台北市的一所研究型公立综合性大学，素有“台湾第一学府”之称，也是一所在国际上享有很高学术声誉的大学。其前身是日本统治时期所建立的台北帝国大学，为当时日本建立的九所帝国大学之一。
1945年，台湾光复后，改名为“台湾大学”。1949年，蒋介石政府迁往台湾，台大取代了当时尚未在台复校的中央大学，成为了台湾地区教育主管部门资助经费第一的高校。
二、台湾成功大学（NationalChengKungUniversity,NCKU），简称“成大”，为中国台湾南部的顶尖综合性研究型大学，有“北台大、南成大”之美誉，为世界大学联盟成员。是分享“迈向顶尖大学计划”5年500亿补助的研究型大学，已发展为学科规模全台第2名的综合大学。台湾地区著名的综合性研究型大学，台湾四所老牌大学（台成清交）之一，台湾综合大学系统成员之一。
三、清华大学（新竹）（NationalTsingHuaUniversity,NTHU），校名全称“国立清华大学”，简称“清大”或清华大学（新竹），为中国顶尖级研究型大学之一，环太平洋大学联盟、中欧商校联盟、东亚研究型大学协会成员。
四、台湾交通大学（NationalChiaoTungUniversity，缩写为NCTU），简称交大，位于中国台湾省新竹市，是台湾顶尖研究型重点大学之一，与台湾清华大学及新竹科学工业园区相邻，与中国大陆四所交大共同联合成立“交通大学校友总会”。
五、台湾政治大学（英语：NationalChengchiUniversity，NCCU），即“国立政治大学”，简称政大，坐落在中国台湾地区台北市文山区，是中国的在文法商及管理学中的顶尖院校，为亚洲及太平洋地区重要智库之一。
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