学院现有各类全日制学生2129人，其中本科生1322人，包括生物医学科学专业28人、临床医学专业1-3年级1294人；基础医学、生物学专业博士、硕士研究生429人，包括硕士研究生263人，博士研究生166人；留学生378人，包括MBBS340人，中文留学生38人。基础医学院不仅承担本院学生的基础课教学任务，还承担着口腔医学院、公共卫生学院、护理学院和药学院等学院各类学生的医学基础课教学任务。
基础医学院坚持以学科建设为基础，积极推进基础医学教育发展，努力创建世界一流学科。学院现有人体解剖与组织胚胎学1个国家级重点学科；人体解剖与组织胚胎学、免疫学、病原生物学、病理学与病理生理学、遗传学、药理学等6个省级重点学科；实验畸形学教育部重点实验室、精神疾病基础与临床山东省重点实验室、感染免疫山东省重点实验室等3个省部级重点实验室；现有基础医学、生物学2个博士后科研流动站，基础医学、生物学2个一级学科博士学位授权点，14个二级学科博士学位授权点。药理学与毒理学、神经科学与行为学、生物学与生物化学、免疫学、分子生物学与遗传学等5个学科进入ESI前1%。
基础医学院不断推进教学科研管理体制机制变革，打破学系限制，建立了24个课程组和32个科研团队。围绕重大疾病发生机制和干预策略研究，已经形成肿瘤学、神经科学、免疫微环境与疾病、代谢性疾病、遗传性疾病等5个研究中心。近五年来承担国家级科研项目150余项，省部级科研项目170余项, 其中国家级重大、重点类科研项目13项，省部级重点类科研项目13项。获资助科研经费累计17100余万。取得国家科技进步二等奖、省部级科技奖、山东省高校科技奖等科研成果19项；发表SCI论文700余篇，其中在《Cell》、《Nature Immunology》、《Nature Communications》、《Nature Chemical Biology》、《PNAS》、《Journal of Clinical Investigation》、《The Journal of Experimental Medicine》、《Gut》、《Gastroenterology》、《Biological Psychiatry》、《Circulation Research》《Journal of the American Society of Nephrology》等国际著名学术期刊上发表多篇高水平学术论文。基础医学院力争经过全院师生的共同努力，形成具有国际先进水平的基础医学学科群，取得国际一流水平的创新性科研成果。
山东大学拥有国家重点实验室2个，省级重点实验室20个，有：
晶体所国家重点实验室、微生物技术国家重点实验室、电子工程实验室、胶体化学开放实验室、高能物理实验室、金融数学实验室、红外遥感研究所、燃煤污染物减排国家工程实验室、电子商务交易技术国家工程实验室、国家胶体材料工程技术研究中心等
拥有一批高水平的教学科研平台：国家级重点学科22个，省级重点学科65个；国家级重点实验室6个，部级重点实验室7个，省高校重点实验室19个；国家工程技术研究中心和国家工程技术推广中心各1个，省级工程技术研究中心27个；教育部人文社会科学重点研究基地4个；国家基础学科人才培养基地6个；“985工程”二期国家重点建设科技平台和人文社科基地12个；是国家大学生文化素质教育基地。
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