银行卡挂失补办后，学校是可以正常扣除学费。
银行卡挂失分为临时挂失和长期挂失，临时挂失为7天，长期挂失，正式挂失后失效。一般来讲口头挂失和书面挂失共需7天，以书面正式挂失为准。书面正式挂失后，口头挂失自动失效，如果一直没有书面挂失，有效期过后被冻结的帐户将自动解动，可连续口头挂失。
如果是普通的借记卡，书面挂失到期后当时(第二天)就能办下来，帐自动转到新卡上，新卡新帐号，输入新密码后当时就能继续使用。挂失费每次10元，补卡工本费每张5元。
你以前的银行卡可以交学费，是因为你通过学校就那张银行卡给了银行一个扣款的授权，你新办的银行卡自然没有这个功能。你可以和学校的财务或学生处联系，应该可以解决的。
此外，如果你新办卡只是卡号变更，而账号、账户未变更，是否需要重新进行扣款授权，你也可以通过财务或学生处问一下。
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