根据最新中国软科大学排名，扬州大学排名全国第69名。
扬州大学的前身可追溯到1902年由中国近代著名实业家、教育家张謇先生创建的通州师范学校，是一所历史悠久、声誉卓著的百年名校。
1902年，张謇在南通创办通海农学堂及通州师范学校。1906年，张謇将通海农学堂附设到通州师范学校，成为该校农科。1952年8月，全国院系调整，南通学院（即私立南通大学）农科与苏南文教学院农业教育系、江南大学农艺系合并建立苏北农学院，即江苏农学院前身；通州师范学校文史专修科与扬州中学数理专修科、苏南丹阳艺术学校艺术专修科、苏北师资训练学校教育专修科合并建立苏北师范专科学校，即扬州师范学院的前身。
1992年5月19日，经国家教委批准，由扬州师范学院、江苏农学院、扬州工学院、扬州医学院、江苏水利工程专科学校、江苏商业专科学校联合组建扬州大学。
学校是全国率先进行合并办学的高校，开创中国高等教育改革先河。因为学校校址在扬州，而不是江苏省会南京，所以失去了很多机会。
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