重庆交通大学的三大优势学科：土木工程、水利工程、交通运输工程，这三个学科均有博士授权点和科研流动站，其实涉及的在山区桥隧、路基路面、内河港航、单轨交通、运输物流等学术领域都是拿过了国家级科技进步奖的。国家级的研究中心如下：
国家工程技术研究中心 国家内河航道整治工程技术研究中心
国家重点实验室培育基地 山区桥梁与隧道工程省部共建国家重点实验室培育基地
国家地方联合工程实验室 交通土建工程材料国家地方联合工程实验室
1、重庆交通大学土木类每届学生200余人。
2、现有交通运输工程、水利工程、管理科学与工程、土木工程等4个一级学科博士学位授权点。
3、土木工程、交通运输工程、水利工程等3个博士后科研流动站。
4、有土木工程、机械工程等16个一级学科硕士学位授权点。
5、土木工程、港口航道与海岸工程、交通运输等3个国家特色专业通过工程教育专业认证，水利水电工程等7个专业获批教育部“卓越工程师教育培养计划”试点专业，有重庆市“三特行动计划”特色专业15个、特色学科专业群7个。
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