北京大学的院系设置主要分为几个学部，每个部下面包含若干学院。
其中理学部包括数学科学学院、物理学院、生命科学学院等；经济与管理学部包括经济学院、光华管理学院等；医学部包括基础医学院、药学院、护理学院等。
北京大学由中华人民共和国教育部直属，中央直管副部级建制，位列“211工程”、“985工程”、“世界一流大学和一流学科”，入选“基础学科拔尖学生培养试验计划”、“高等学校创新能力提升计划”、“高等学校学科创新引智计划”。
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