南通现有两所二本大学：南通大学和南通理工学院。南通大学创建于1912年，位于江苏省南通市，是一所多学科，多层次的普通本科院校。南通理工学院创建于1978年，位于江苏省南通市，是一所集理、工、管、艺四大学科于一体的本科院校。两所大学各有千秋，各有特色。如果你是考生或者家长，可以根据选择的专业和学校的教学质量、学校环境等方面进行综合评估，选择适合自己的大学。
南通大学杏林学院综合实力较强，下面从多角度进行二者的分析对比：
一、师资力量
1、南通大学杏林学院：雄厚的师资队伍，共享母体优质的教育教学资源，专任教师中有教授159 人，副教授518人。
2、南通理工学院：学校有专任教师768人，教师总数821人；在专任教师中，教授或相当专业技术职务者100人，副教授或相当专业技术职务者250人，高级职称教师占专任教师总数的45.57%。
二、院系专业
1、南通大学杏林学院：设有39个专业(方向)。
2、南通理工学院：学校设有11个二级学院，设置本科专业36个。
三、学科建设
1、南通大学杏林学院：设有“中国国家知识基础设施工程”( CNKI )知识网络一级管理服务中心。
2、南通理工学院：近三年来，学校获批江苏省“十三五”一级重点建设学科2项。
以上内容参考 百度百科——南通大学杏林学院
以上内容参考 百度百科——南通理工学院
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