高校武装部的机构设置各高校均有不同，以清华大学为例，武装部内设机构有国防教育办公室、国防人才办公室、军事教研室、联合培养飞行学员办公室、武装部办公室。
四川师范大学武装部则设有综合科、辅导员发展中心、教育管理科、大学生心理发展中心、大学生资助中心、网络思政与信息化建设科（学校易班发展中心办公室）、国防教育军事训练办公室（征兵工作站办公室）、大学生学业与职业发展中心。
高校武装部主要职责
1、贯彻执行学生军训的方针政策。
2、负责组织学生军训，制定学生军训和军事课教学计划，并具体组织实施。
3、负责学生军训的枪支、器材管理和物资保障等工作。
4、制定学生军训和军事课教学有关的规章制度。
5、组织武装干部和军事教师的政治、业务学习和培训。
6、协助学校相关部（处）巩固学生军训成果；协助学校相关部门组织教职工国防教育工作。
以上内容参考 清华大学武装部-组织结构
以上内容参考 四川师范大学学生工作部、武装部-机构设置
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