塔里木大学研究生专业有作物栽培学与耕作学、作物遗传育种、果树学、蔬菜学、农艺与种业、资源利用与植物保护、农业工程与信息技术、水生生物学、畜牧学、兽医、植物学、动物学、微生物学、生物化学与分子生物学、生物资源化学、食品生物技术、化学工程与技术、化学工程、食品加工与安全、农业水土工程、农业机械化工程、农业工程、农村发展、农业经济管理、林业经济管理、学科教学（语文）、学前教育、新闻与传播、农业电气化与自动化、园艺信息技术、西域屯垦史。
果树学
本研究方向以发展都市农业和特色园艺植物为目的，着力开展优良果树种质资源的收集、评价和选育及抗逆性植物资源的研究与利用。通过传统理论和现代化生物技术等手段和方法，探讨特殊条件下果树植物的生态适应机制、各种环境因子的相互作用对果树生长的影响和主栽果树的物质生产特性，进行抗逆植物种类的开发与利用，从而选育和推广经济价值较高的耐盐植物，为天津市滨海滩涂盐碱地的开发和利用奠定理论基础。
蔬菜学
蔬菜学是以生物学为理论基础，研究蔬菜作物生长发育和遗传规律的一门学科，也是研究蔬菜种质资源、遗传育种、栽培、病虫害防治及采后处理、贮藏、加工等应用技术与原理的综合性专业学科。
塔里木大学城乡规划专业在水利与建筑工程学院。
学校于1975年成立水利系，1998年水利系与农机系等合并成立农业工程学院，为了适应新形势下的学科、专业发展要求，经学校统一调整，于2008年对原农业工程学院进行重组，成立水利与建筑工程学院。学院现有农业水利工程、土木工程、农业建筑环境与能源工程、城市规划4个本科专业。
水利与建筑工程学院下设3个办公室（学院、教务、学生），6个教研室（水利工程、力学与建材、结构、土木工程、建筑与规划和测绘与地质）。现有教职工54人。教授4人、副教授8人、讲师22人，硕、博士（含在读）36人。拥有全日制在校生1162人，其中本科生1060人，专科生89人，研究生13人。
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