福州大学于2005年开始以筹建形式成立研究生院。目前在校各类研究生已达到8400多人，是福建省唯一的全国专业学位研究生教育综合改革试点高校和全国工程硕士研究生教育创新院校。2012年12月福州大学研究生院的正式成立，将为推动福州大学创业型东南强校建设，在更高起点上推进学位与研究生教育搭建更广阔的平台。
学校现有18个学院和单位培养研究生：数学与计算机科学学院、物理与信息学院、化学化工学院、土木工程学院、紫金矿业学院，机械工程及自动化学院、材料科学与工程学院、生物科学与工程学院、电气工程与自动化学院、环境与资源学院、管理学院、法学院、人文社会科学学院、公共管理学院、外国语学院、软件学院、厦门工艺美术学院、图书馆。全校现有1个化肥催化剂国家工程研究中心，1个教育部工程研究中心，1个省部共建国家重点实验室培育基地，3个省部共建教育部重点实验室。
福大研究院不是教育部承认的独立研究院。
福州大学创办于1958年，校园座落在福州市西郊闽江之滨。福州大学坚持理工结合和多学科发展的指导方针，以厦门大学部分专业和专门化为基础，设立数学、物理学、化学、机械工程、电机工程、化学工程、无线电工程、土木建筑工程、采矿冶金工程等9个系。
分设数学、计算数学、物理学、无线电技术、机械制造工艺及设备、铸造、发电厂电力网及电力系统、电机与电器、无机物工学、基本有机合成、工业企业电气化、力学、工业与民用建筑、道路与桥梁、采矿工程、冶金工程等17个专业。
2018年3月，福州大学入选教育部首批“新工科”研究与实践项目；同月，学校入选福建省一流大学建设高校。7月，国防科技工业局、教育部联合发文，决定“十三五”期间新增一批共建高校，福州大学入选。10月23日，福建省首家双授学位的中外合作办学机构——福州大学梅努斯国际工程学院，在旗山校区图书馆博学厅举行揭牌成立仪式。
福州大学研究生在福州大学旗山校区，地址是闽侯大学城新区学园路2号。福州大学旗山校是福州大学为了扩大办学水平而建设的高水平新校区，校园硬件软件设备齐全，学习氛围浓厚，与旗山国家森林公园互相倚靠。
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