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重庆大学有国家自然科学基金地区项目，重庆大学物理学院吴兴刚教授牵头申报的“西南理论物理中心”项目获批2021年国家自然科学基金理论物理专款项目资助。
自然科学基金委是管理国家自然科学基金的国务院直属的事业单位，自然科学基金坚持支持基础研究，逐渐形成和发展了由研究项目、人才项目和环境条件项目三大系列组成的资助格局。
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