这两个学校各有侧重
复旦文科中的文史哲很好，理科中的数理化很好，工科很少，微电子很好，计算机专业实力不如交大。交大计算机系不少学生都是拒绝清华的报送来到交大读书的，他们的选择也说明一些问题了吧。
复旦几乎没有理工科，所以几乎没法比较。
如果你要学习纯理科，比如化学，基础数学之类的，那么复旦更好的
交大的理工科却方向很多，发展的平台很好，并且都很强大，如果学习理工科尤其是工程学科，首选交大。
交大最大的几个理工科学院简单说说，就业深造去向都很好，所以不一一说明了：
船舶海洋学院，一直国内排名第一，这是交大很强大的学院
机动学院；交大的机械学科排名也是国内排名第一的；
电信学院；实力很强大，虽然没有排名第一的专业，但是学院综合实力在国内顶尖，就业深造都是最好的，所以实际上交大的电院是最热门的。现在理工科的电子信息类还是挺热的，所以属于交大的热门学院。
材料学院，交大的这个学院也是曾经排名第一的，现在也是实力一流的，就业去向各大汽车公司，宝钢等等国企外企，出国的也很多。
交大在理工科的建树还是不少的，给国家贡献和人才培养上，那就说几个著名的理工科方面的校友来说明吧：
联想集团是国内IT行业的老大，杨元庆就是交大计算机系毕业的，他打造了联想的辉煌；
TP-link的建立者是赵建军，他也是交大计算机系毕业的，TP-link是国内路由器网络设备的行业老大，你应该知道吧。前几天赵建军刚给交大捐款3000万元。
微软集团（生产Microsoft操作系统，服务器，office等 ）的亚洲搜索中心的总负责人 王永东 也是交大计算机系毕业的；
华为上海研究院院长也是交大电子工程系毕业的；
中国高清电视的标准制定者就是交大电子工程系负责指定的，总负责人是张文军；
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例子太多了，我就无法一一列举了。
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