2004年5月,经国家教育部批准,原南通医学院、南通工学院、南通师范学院合并组建南通大学。南通大学现有四个校区，分别是主校区、启秀校区、文峰校区和钟秀校区，占地2286.77亩，校舍总面积61.93万平方米。
根据2014年6月学校官网显示，南通大学设有94个本科专业，25个学院、1个独立学院、1个国际教育学院和1个继续教育学院，拥有1所近百年历史的大型综合三级甲等附属医院。
最好的学科有：
国家重点学科培育建设点（1个）：人体解剖与组织胚胎学
省高校优势学科（2个）：基础医学、新能源及其装备
省一级学科重点学科（6个）：基础医学、信息与通信工程、临床医学、中国语言文学、特种医学、美术学
省重点学科（6个）：人体解剖与组织胚胎学、 中国古代文学、通信与信息系统、航空、航天与航海医学、内科学、外科学
省重点建设学科（3个）：机械设计及理论、控制理论与控制工程、眼科学
省优秀学科梯队（5个）：人体解剖与组织胚胎学、中国古代文学、机械设计及理论、通信与信息系统、骨外科
省医学重点学科（3个）：手外科、眼科学、实验诊断学
省临床医学中心（1个）：手外科
省临床医学重点专科（10个）：血液内科、消化内科、心血管内科、普外科、骨外科、眼科、医学检验神经内科 、皮肤性病学、肾内科。
南通大学有4个校区,分别是主校区、启东校区、启秀校区和钟秀校区。
1、主校区，南通市崇川区啬园路9号，有文学院、理学院、商学院、外国语学院、机械工程学院、电子信息学院、电气工程学院、计算机科学与技术学院、建筑工程学院、纺织服装学院。
2、启东校区，江苏省南通市启东市西振海路111号，有公共卫生学院、地理科学学院、理学院、法政与管理学院。
3、启秀校区，江苏省南通市崇川区启秀路19号，有护理学院、医学院。
4、钟秀校区，南通市外环东路999号，有教育科学学院、生命科学学院、体育科学学院、地理科学学院、艺术学院。
温馨提示：
