2000年以来,学院教师先后主持国家杰出青年基金1项、国家自然科学基金重点项目1项、国家自然科学基金面上项目22项、国家科技部863项目1项,国家973项目子课题4项,教育部科学技术重点项目2项、教育部博士点专项基金2项、云南省自然科学基金26项(其中重点项目4项,跨世纪人才项目2项)。发表SCI、EI论文300余篇,获云南省自然科学技术类一等奖4项、二等奖2项、三等奖4项。“数理基地建设”项目获云南省高等教育教学成果一等奖。形成了理论天体物理、光学、随机动力学、非线性科学、电子科学与技术、环境功能材料、光电信息材料、生物医用材料、材料模拟计算等多个研究群体。