华东理工大学研究生院设有材料与化工，生物与医药，机械，能源动力，材料与化工，电子信息，资源与环境，药学，会计，社会工作，翻译，艺术，法律（非法学），法律（法学），金融，工商管理，工程管理，项目管理，公共管理等等专业。
学校现有13个一级学科博士点化学工程与技术、化学、材料科学与工程、控制科学与工程、动力工程及工程热物理、环境科学与工程、机械工程、轻工技术与工程、数学、药学、应用经济学、社会学、管理科学与工程，80个二级学科博士点；有27个一级学科硕士点，142个二级学科硕士点。
学校现有工商管理（MBA、EMBA）、公共管理（MPA）、法律（JM）、社会工作（MSW）、会计（MPAcc）、药学（M.Pharm）、中药学（MCMM）、艺术?(MFA)、工程(ME，18个领域)、金融（MF）、翻译（MTI）和工程管理（MEM）等12个硕士专业学位授予权。
华东理工大学的生物工程专业专业创建于1955年，当时的专业名称为“抗菌素制造工学”。它为中国抗生素工业从无到有、由弱变强、遍地开花作出了划时代的贡献。
专业现有生物化工、发酵工程2个博士点，发酵工程、生物化工、微生物学、微生物与生化药学4个硕士点。现有教职工71名，其中长江学者1名，教授10名，副教授25名。
专业拥有生物反应器工程国家重点实验室和国家生化工程技术研究中心，2001年被列入上海市重点学科，2002年被批准为国家重点学科。本专业教师承担国家自然科学基金、国家攻关、“863攻关”及上海市科委的重大科技攻关项目，并取得了国家科技进步奖、上海市科技进步奖等多项成果。
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