哈佛早期的校训是“察验真理”(Veritas [1643年])、“荣耀归于基督”(In Christ Gloriam [1650])，以及“为基督?6?1为教会”(Christo et Ecclesiae [1692年])。哈佛早期印章展示三本翻开的书本，两本面向上，一本面向下，象征着理性(reason)与启示(revelation)之间的动力关系。哈佛的一份最早期文献——1642年的学院法例——如此写道："让每一位学生都认真考虑以认识神并耶稣基督为永生之源(约17:3)，作为他人生与学习的主要目标，因而以基督作为一切正统知识和学习的惟一基础。所有人既看见主赐下智慧，便当在隐密处认真借着祷告寻求他的智慧。"
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