学院先后承担了国家“973”、国家“863”、国家自然科学基金和国家重点研发计划等一批科研项目，承担了三峡工程、南水北调等一批重大水利水电工程的技术咨询和科研攻关项目，取得了一批具有原创性的科技成果，推动了我国水利水电科技的发展。2006 年以来共获国家科技进步二等奖 10 项，其中第一完成单位 5 项、第二完成单位 3 项，以第一单位获省部级科技一等奖 14 项。2000 年至今出版专著、教材 80 余部，现有国家级精品课程 3 门、省级精品课程 1 门、武汉大学精品课程 3 门。2001 年、2005 年和 2009 年三次获得国家教学成果奖。
学院与美国劳伦斯伯克利国家实验室、英国帝国理工学院、挪威奥斯陆大学、新加坡国立大学等国际知名高校和研究机构建立了科技交流与学生培养的长期合作关系。
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