清华大学的院系有二十多个，分别是建筑学院、土木水利学院、环境学院、机械工程学院、航天航空学院、电机工程与应用电子技术系、信息科学技术学院、交叉信息研究院、工程物理系、化学工程系、材料学院、理学院、生命学院、公共管理学院、经济管理学院、社会科学学院、人文学院、法学院、新闻与传播学院、美术学院、医学院/北京协和医学院－清华大学医学部、医学院。
例举部分如下：
1、清华大学医学院：清华大学医学院成立于2001年10月25日，首任院长由中国著名医学科学家、两院院士吴阶平教授担任。生物物理学家赵南明教授，结构生物学家施一公院士，神经科学家鲁白教授，免疫学家董晨教授先后担任常务副院长。2016年9月，董晨教授担任医学院院长。
2、清华大学机械工程学院：清华大学机械工程学院渊源于1932年成立的清华大学工学院“机械工程学系”。目前包含“机械工程系”、“精密仪器系”、“热能工程系”、“汽车工程系”、“工业工程系”以及“基础工业训练中心”6个部门。
3、清华大学自动化系：清华大学自动化系成立于1970年。1970年5月，清华大学将一批有关的专业联合建立起国内第一个自动化系（初期名为工业自动化系），其人员主要来源于电机系和动力机械系两大部分。
4、清华大学环境科学与工程系：清华大学环境科学与工程系成立于1977年，清华大学在我国首批设立了环境工程专业，1988年被评为我国环境工程唯一的重点学科，2001年和2006年蝉联重点学科。
5、清华大学经济管理学院：清华大学经济管理学院的前身可追溯到1926年创建的清华大学经济系，中国经济学界泰斗陈岱孙教授于1928年出任系主任。
参考资料
清华大学专业有建筑学、城乡规划、风景园林、建筑环境与能源应用工程、土木工程、工程管理、交通工程、水利水电工程、水利科学与工程、电气工程及其自动化、经济学、社会学、国际政治等。
清华大学招生专业类：清华大学按照16个大类进行本科招生，涵盖本科专业81个，第二学位专业18个。
按照招生专业分类
建筑类
土木类
环境、化工与新材料类
机械、航空与动力类
能源与电气类
电子信息类
计算机类
自动化与工业工程类
数理类
化生类
经济、金融与管理类
人文与社会类
法学类
艺术类
文理通识类
临床医学类
按照院系分类
建筑学院
土木水利学院
环境学院
机械工程学院
电机工程与应用电子技术系
信息科学技术学院
交叉信息研究院
航天航空学院
工程物理系
化学工程系
材料学院
理学院
生命科学学院
医学院
生物医学工程系
药学院
协和医学院
经济管理学院
人文学院
社会科学学院
法学院
新闻与传播学院
美术学院
新雅书院
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