专业选择上，当然并不是每一个学校都像北京大学，明确列出了高校专项计划的招生专业，
由东南大学官方发布“东南大学2022年高校专项“筑梦计划”招生简章”可以了解到，东南大学将依据公布的分省分专业招生计划，按照考生高考投档成绩(含政策性加分)从高分到低分依次择优录取，同时根据东南大学招生章程中的规定为学生分配专业。
但是，根据往年学生统计，东南大学高校专项计划专业大概包括：材料科学与工程、管理科学与工程、机械类、自动化类、计算机类专业等。国家专项计划专业有材料科学与工程、管理科学与工程、机械类、自动化类、计算机类、通信工程、冶金工程、土木工程、能源动力、应用物理学、应用化学、农学、园艺、园林、植物保护、草业科学、动物科学、农业工程、动物医学、农村区域发展、地理科学等。
东南大学自1952年全国高校院系调整后就开始招收研究生，50年代后期和60年代初期共招收研究生117人，1978年恢复招收研究生，1981年实施学位条例后， 是首批获学士、硕士、博士学位授予的单位；是首批建有博士后流动站的单位。
2020年，继续坚持按需招生、全面衡量、择优录取、宁缺毋滥的原则，拟招收全日制攻读硕士学位研究生（包括学术学位和专业学位）和非全日制攻读硕士专业学位研究生5100名左右（最终以教育部正式下达的招生计划文件为准）；拟招收校内外推荐免试生2000名左右（最终以推免生系统确认的录取人数为准）。
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