清华大学的院系有二十多个，分别是建筑学院、土木水利学院、环境学院、机械工程学院、航天航空学院、电机工程与应用电子技术系、信息科学技术学院、交叉信息研究院、工程物理系、化学工程系、材料学院、理学院、生命学院、公共管理学院、经济管理学院、社会科学学院、人文学院、法学院、新闻与传播学院、美术学院、医学院/北京协和医学院－清华大学医学部、医学院。
例举部分如下：
1、清华大学医学院：清华大学医学院成立于2001年10月25日，首任院长由中国著名医学科学家、两院院士吴阶平教授担任。生物物理学家赵南明教授，结构生物学家施一公院士，神经科学家鲁白教授，免疫学家董晨教授先后担任常务副院长。2016年9月，董晨教授担任医学院院长。
2、清华大学机械工程学院：清华大学机械工程学院渊源于1932年成立的清华大学工学院“机械工程学系”。目前包含“机械工程系”、“精密仪器系”、“热能工程系”、“汽车工程系”、“工业工程系”以及“基础工业训练中心”6个部门。
3、清华大学自动化系：清华大学自动化系成立于1970年。1970年5月，清华大学将一批有关的专业联合建立起国内第一个自动化系（初期名为工业自动化系），其人员主要来源于电机系和动力机械系两大部分。
4、清华大学环境科学与工程系：清华大学环境科学与工程系成立于1977年，清华大学在我国首批设立了环境工程专业，1988年被评为我国环境工程唯一的重点学科，2001年和2006年蝉联重点学科。
5、清华大学经济管理学院：清华大学经济管理学院的前身可追溯到1926年创建的清华大学经济系，中国经济学界泰斗陈岱孙教授于1928年出任系主任。
参考资料
目前，清华大学设有建筑学院、土木水利学院、机械工程学院、航天航空学院、信息科学技术学院、理学院、生命科学学院、医学院、地球科学学院（筹）、人文社会科学学院、新闻与传播学院、法学院、马克思主义学院、经济管理学院、公共管理学院、美术学院、应用技术学院等，以及清华大学生物科学与技术系（2009年9月28日成立清华大学生命科学学院，同时撤销该建制）、生物信息与系统生物学、医学系统生物学研究中心等院系。清华大学已成为一所具有理、工、文、法、医学、经济、管理、艺术等学科的综合性大学。
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