南京农业大学的机械制造与自动化在浦口校区（南京农业大学工学院）。
学院由1952年原中央大学农业工程系和金陵大学农业工程系合并成立的南京农学院农业机械化系而来，同年，在浦口校区成立华东机械化农业学校（1955年更名为南京农业机械化学校），1958年，农业机械化系与江苏省南京农业机械化学校合并成立南京农学院农业机械化分院，2000年，南京农学院农业机械化分院更名为南京农业大学工学院。
2020年，学校将农业工程学科及机械工程学科及相关专业合并组成新的工学院。
院系专业
截至2019年9月学院官网显示，学院设有4个系，有12个本科专业。
系：农业机械化系、机械工程系、电气工程系、管理工程系。
本科专业：农业机械化及其自动化、交通运输、车辆工程、机械设计制造及其自动化、材料成型及控制工程、工业设计、农业电气化、电子信息科学与技术、自动化、工业工程、工程管理、物流工程。
学科建设
截至2019年9月学院官网显示，学院拥有1个博士后科研流动站、1个一级学科博士点、3个二级学科博士点、3个一级学科硕士点、9个二级学科硕士点、3个专业硕士学位授权类别、4个专业硕士学位授权领域。
博士后科研流动站：农业工程。
一级学科博士点：农业工程。
二级学科博士点：农业机械化工程、农业电气化与自动化、农业生物环境与能源工程。
一级学科硕士点：农业工程、机械工程、管理科学与工程。
二级学科硕士点：农业机械化工程、农业电气化与自动化、农业生物环境与能源工程、机械设计及理论、机械制造及其自动化、机械电子工程、车辆工程、管理科学与工程、检测技术与自动化装置。
专业硕士学位授权类别：电子信息、机械、工程管理。
专业硕士学位授权领域：农业工程、机械工程、物流工程、农业机械化。
以上内容参考：百度百科-南京农业大学工学院
学院有农业机械化及其自动化、机械设计制造及其自动化、机械电子工程、电子信息工程和车辆工程等5个本科专业。其中农业机械化及其自动化专业是陕西省双一流建设专业，农业机械化及其自动化与机械设计制造及其自动化专业是陕西省特色专业；有农业机械化工程、农业生物环境与能源工程、农业电气化与自动化、机械设计及理论、机械制造及其自动化、机械电子工程、车辆工程等7个硕士学位授权点；拥有农业工程一级学科博士点及农业工程博士后流动站；农业机械化工程、农业生物环境与能源工程、农业电气化与自动化等3个博士学位授权点为陕西省重点学科。
学院拥有农业农村部农业物联网重点实验室、农业农村部苹果全程机械化科研基地、北方农业装备科学观测实验站、农业农村部农村可再生能源开发利用西部科学观测实验站、陕西省农业装备工程技术研究中心、陕西省农业信息感知与智能服务重点实验室、陕西省农业机械化发展研究中心、杨凌现代农业国际研究院等科研平台。在学术院长罗锡文院士指导下，形成了旱作农业机械与备、精准农业关键技术与装备、生物质综合利用等3个学科方向、10个研究团队。
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