南通大学属于双非学校中档次较高的大学。南通大学是江苏省十五所中重点建设大学成员，也是南通唯一一所公办本科大学，所以可以说南通大学是南通最好的学校。
在校友会2020中国大学排名中，南通大学排在全国第206名，低于湖北的三峡大学，高于四川的西南民族大学；在江苏省内排在第18名，低于南京信息工程大学。而在2020软科中国大学排名中，南通大学排在全国第146名，低于天津师范大学；在省内排在第20名，低于江苏科技大学。
可见，南通大学在全国排在200名左右，并且在省内也排名在中段，可以称的上是一所中等水平的高校。南通大学的学科实力、教学建设还是不错的，其中医学类学科的实力较为突出，还拥有国家特色专业建设点及多个实验室及研究基地。
南通大学的就业率也是非常可观的，总体就业率为98.12%，其中有一半以上的专业都达到了100%的就业率；除会计学、市场营销、公共事业管理（医学法学）、信息管理与信息系统4个专业以外，其余所有的专业就业率都达到了90%以上。
以上内容参考：百度百科-南通大学
南通大学总体来说比较好，学科建设比较全面，校园环境也相对好一些，下面是苏州科技学院和南通大学的各方面对比介绍
一、师资力量
1、苏州科技学院：学校共有教职工1648人，其中专任教师1300余人。专任教师中，具有高级专业技术职务的教师600余人，其中教授161人，博士学位教师392人。
2、南通大学：有教职工3367人（含杏林学院152人），其中高级职称以上1659人，博士、硕士生导师1550余人。
二、教学建设
1、苏州科技学院：学校拥有3个国家级特色专业建设点、1个国家大学生文化素质教育基地、1个国家级高校学生科技创业实习基地、1个国家级校外实践教育基地。
2、南通大学：学校拥有5个国家特色专业建设点，20个江苏省品牌专业、省科教兴卫工程重点学科、省临床医学重点专科。
三、科研成果
1、苏州科技学院：共承担科研项目2423项，年均科研经费1.35亿元。承担包括国家科技重大专项、国家“973”项目、“863”项目、国家自然科学基金（重点）项目、国家社会科学基金项目等在内的国家级项目258项。
2、南通大学：学校共承担“973”计划课题2项、“863”计划课题3项、国家科技重大专项1项、国家自然科学和社会科学基金350余项，获发明授权140余项。
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