名 称 主 任 病毒学国家重点实验室 吴建国 杂交水稻国家重点实验室（武汉大学） 何光存 湖北梁子湖湖泊生态系统国家野外观测研究站 于 丹 植物生物技术与遗传资源利用教育部工程研究中心 朱英国
武汉大学拥有7个国家人文社会科学重点研究基地，4个国家重点实验室，2个国家工程技术研究中心10个教育部重点实验室，4个教育部工程研究中心，2个高级综合研究机构。
国家人文社会科学重点研究基地（7个）
信息资源，社会保障，国际法，环境法，中国传统文化，经济发展，媒体发展。
国家重点实验室（5个）
软件工程，测绘遥感信息工程，水资源与水电工程科学，病毒学，杂交水稻。
国家工程技术研究中心（2个）
多媒体软件，卫星定位系统。
教育部重点实验室（10个）
声光材料与器件，生物医学分析化学，生物医用高分子材料，植物发育生物学，地理信息系统，水沙科学,地球空间环境与大地测量，水力机械过渡过程，空天信息安全与可信计算，口腔生物医学工程。
教育部工程研究中心（4个）
有机硅化合物及材料，建筑物检测与加固，植物生物技术与遗传资源利用，雷电防护与接地技术。
高级综合研究机构（2个）
高级研究中心、国际问题研究院。
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