合并后确实各有利弊：
利：可以资源共享，学生能得到相对平等的教育，同时也有利于教师队伍整体建设的良好发展；
弊：有些学生不良的学习习惯可能会对较好学校的原有环境造成影响。
一、合并后的西南大学与原西南师范、西南农业比，没有劣势。只有优势。
二、合并后的西南大学，从西南师范大学单一的师范类学校、西南农业大学单一的农科学校，发展成为学科门类齐全的综合性大学，涵盖经、法、教、文、史、理、工、农、医、管、艺等12个学科门类，55个一级学科。学校现有32个学院（部），21个一级学科博士学位授权点，46个一级学科硕士学位授权点；1种专业博士学位，19种专业硕士学位，107个本科专业。
学校拥有3个国家重点学科、2个国家重点（培育）学科、37个省部（市）一级重点学科、18个博士后科研流动站。学校科研实力雄厚，建有北碚国家大学科技园、1个国家重点实验室、1个国家工程技术研究中心、1个省部共建国家重点实验室培育基地、10个教育部或农业部重点实验室、2个国家野外科学观测试验站、2个农业部综合实验站、2个国土资源部野外基地、3个教育部工程研究中心、2个国家创新引智基地、3个教育部创新团队、1个教育部人文社会科学重点研究基地。
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