没有区别，师资没问题，考的专业在哪个校区就到那个校区去读书，自己不可以选择。但是通过报考专业，看准了专业导师在哪个校区就报他专业就等于选择校区了。读研期间可以做点社会工作，也可以找点助教的事干，主要看精力了。
北京大学深圳研究生院只有研究生，没有本科生，师资什么的大致差不多，深圳也蛮有资本的，而且处于技术的前沿阵地，这边的实习机会比较多，从早上八九点到晚上十一二点都在忙，北京大学深圳研究生院，但是硕士所发证书是一样的，但是论文答辩什么的要回北京去搞，要在深圳上学。
北京大学深圳研究生院的学院和专业：
北京大学深圳研究生院下设信息工程学院、化学生物学与生物技术学院、环境与能源学院、城市规划与设计学院、汇丰商学院、国际法学院、新材料学院等七个学院。
专业设置涉及信息科学与技术、电子与通讯技术、化学生物学、环境科学、环境与能源、城市与区域规划、景观设计、社会学、心理学、新闻传播、金融、经济、管理、法律等领域。
以上内容参考百度百科——北京大学深圳研究生院
北大知名度很高的汇丰商学院其实是深圳研究生院的下设学院。
北京大学深圳研究生院是北京大学与深圳市政府合作创办的，是坐落在深圳的北京大学国际化校区，是北京大学创建世界一流大学的重要组成部分，也是北京大学医学部等各学部的平级单位。
北大深院和本校部的毕业证都是一样的，而且经过这几年的发展，丝毫不亚于本校部，甚至某些专业比本校部都难，当然大部分专业相比本校部是容易一点的。
北大深圳研究生院创建于2001年，经过十几年发展，逐步成为扎根深圳的北大研究型国际化校区；现有全日制在校研究生2873人，其中硕士研究生2574人，博士研究生236人。
深圳研究生院依托北京大学学科优势，结合深圳的区位优势，以“前沿领域、交又学科、应用学术、国际标准”为办学方针，加强学科建设。
现有信息工程学院、化学生物学与生物技术学院、环境与能源学院、城市规划与设计学院、新材料学院、江丰商学院、国际法学院以及人文社会科学学院等八个学院。
深圳研究生院2017届毕业生就业质量不弱于本部，甚至超过本部研究生整体水平！与本部相比，还有一个最大的就业优势：灵活就业率极低极低！留北京很难落户，而留深圳则没这些烦恼~
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