吉林省共有22所二本大学参与了吉林二本大学排名理科，其中排名第一的是北华大学，排名第二的是长春工业大学，排名第三的是吉林师范大学，排名前10的大学还有吉林工程技术师范大学、通化师范学院、吉林财经大学、长春师范大学等。
以下是吉林二本大学排名理科2016具体榜单，根据理科二本录取平均分排名，包含部分专业在二本招生的一本大学。
| 吉林二本大学排名 | 学校名称 | 录取批次 | 录取线差 | 分数线 | 录取平均分 |
| 1 | 北华大学 | 本科二批 | 115 | 405(第二批) | 520 |
| 2 | 长春工业大学 | 本科二批 | 517 | ||
| 3 | 吉林师范大学 | 本科二批 | 106 | 405(第二批) | 511 |
| 4 | 吉林工程技术师范学院 | 本科二批 | 103 | 405(第二批) | 508 |
| 5 | 通化师范学院 | 本科二批 | 101 | 405(第二批) | 506 |
| 6 | 吉林财经大学 | 本科二批 | 101 | 405(第二批) | 506 |
| 7 | 长春师范大学 | 本科二批 | 93 | 405(第二批) | 498 |
| 8 | 吉林医药学院 | 本科二批 | 90 | 405(第二批) | 495 |
| 9 | 白城师范学院 | 本科二批 | 88 | 405(第二批) | 493 |
| 10 | 吉林农业大学 | 本科二批 | 85 | 405(第二批) | 490 |
| 11 | 长春中医药大学 | 本科三批 | 74 | 405(第二批) | 479 |
| 12 | 吉林建筑大学 | 本科三批 | 66 | 405(第二批) | 471 |
| 13 | 长春大学 | 本科三批 | 61 | 405(第二批) | 466 |
| 14 | 长春工程学院 | 本科三批 | 54 | 405(第二批) | 459 |
| 15 | 长春理工大学 | 本科三批 | 44 | 405(第二批) | 449 |
| 16 | 吉林警察学院 | 本科二批 | 42 | 405(第二批) | 447 |
| 17 | 吉林工商学院 | 本科三批 | 37 | 405(第二批) | 442 |
| 18 | 长春科技学院 | 本科三批 | 26 | 405(第二批) | 431 |
| 19 | 吉林化工学院 | 本科三批 | 25 | 405(第二批) | 430 |
| 20 | 吉林华桥外国语学院 | 本科三批 | 25 | 405(第二批) | 430 |
| 21 | 吉林体育学院 | 本科三批 | 23 | 405(第二批) | 428 |
| 22 | 吉林农业科技学院 | 本科三批 | 18 | 405(第二批) | 423 |
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