海军军医大学第四轮学科评估于2016年4月启动，按照“自愿申请、免费参评”原则，采用“客观评价与主观评价相结合”的方式进行。评估体系在前三轮的基础上进行诸多创新；评估数据以“公共数据和单位填报相结合”的方式获取；评估结果按“分档”方式呈现，具体方法是按“学科整体水平得分”的位次百分位，将前70%的学科分9档公布：前2%（或前2名）为A+，2%～5%为A（不含2%，下同），5%～10%为A-，10%～20%为B+，20%～30%为B，30%～40%为B-，40%～50%为C+，50%～60%为C，60%～70%为C-。
| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 一级学科代码 | 一级学科名称 | 评选结果 |
| 1 | 90030 | 第二军医大学 | 1011 | 护理学 | A+ |
| 2 | 90030 | 第二军医大学 | 1001 | 基础医学 | A- |
| 3 | 90030 | 第二军医大学 | 1007 | 药学 | A- |
| 4 | 90030 | 第二军医大学 | 1002 | 临床医学 | B+ |
| 5 | 90030 | 第二军医大学 | 1004 | 公共卫生与预防医学 | B+ |
| 6 | 90030 | 第二军医大学 | 1006 | 中西医结合 | B |
| 7 | 90030 | 第二军医大学 | 1204 | 公共管理 | B |
| 8 | 90030 | 第二军医大学 | 1008 | 中药学 | C+ |
学校现为国家“双一流”重点学科建设院校、国家“211工程”重点建设院校，是36个“国家生命科学与技术人才培养基地”之一。我校设有全国唯一的中医学八年制专业，现有的海军医学系、卫生勤务学系、中医系、麻醉系均为全军唯一的专业系。学校一级国家重点学科数2个，二、三级国家重点学科数26个；现有硕士学位授权点93个、博士学位授权点83个、博士后流动站7个。学校始终处于全军院校和全国医科院校第一方阵，在2019年最新世界大学排名（ESI）中，有7个学科入选全球前1%，位居全军院校第一。
名师大家精英云集。建校以来，学校共为军队输送了12万余名合格医学人才，培养了全军85%以上的海军卫生干部、80%的卫勤管理干部、85%的军事药学人才。以吴孟超院士为代表的7名院士数，领跑全国医科院校（综合性大学除外）。学校拥有国家教育部“奖励计划”9名，“百千万人才工程”国家级人选12名，国家杰出青年科学基金获得者26名，7人入选何梁何利奖，10人被评为全国优秀科技工作者，此外还有一大批高端人才入选国家、军队和省部级各类人才奖励计划，人才数质量位居全国医科院校前列，为学校教育事业领航导向。
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