注册公司会计核算方式，多指注册公司时填写的基本情况登记表上的核算形式，即“独立核算”或“非独立核算”，一般来说，总公司填写独立核算，分公司填写非独立核算。
独立核算，是指对本单位的业务经营活动过程及其成果进行全面、系统的会计核算。独立核算单位在管理上有独立的组织形式，具有一定数量的资金，在当地银行开户；独立进行经营活动，能同其他单位订立经济合同；独立计算盈亏，单独设置会计机构并配备会计人员，并有完整的会计工作组织体系。
非独立核算，又称报账制，是把本单位的业务经营活动有关的日常业务资料，逐日或定期报送上级单位，由上级单位进行核算。
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