季节性冻土普遍存在，冻结层冻结和融解时间，随各地气温而异。地表开始冻结日期，兴安山地在10月下旬，松嫩平原和三江平原在11月上旬，长白山地和本区南部平原在11月中、下旬。融冻日期，从3月中、下旬自南向北逐渐融解。土壤冻结期为4～6个月，甚至长达7个月。冻土层厚度，除东南一隅不足1米外，其他各地均在1米以上。东部山地厚1～1.5米，松嫩平原厚1.5～2.0米，大小兴安岭厚达2米以上。总之，从南向北，冻结厚度逐渐加大，冻结时间逐渐加长。
多年冻土，主要分布在大、小兴安岭地区，属于亚欧大陆高纬度多年冻土区的南缘地带。其分布自西北向东南，面积逐渐缩小，厚度相应变薄。
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