1.主要成分不同：生产木蜡油所用的原料，一般都是从天然植物中提取的，所以木蜡油一般不含有毒物质。而生产清漆所用的原料，一般都含有化学成分，其中树脂是有毒的。
2.涂刷环境要求不同：木蜡油不仅可以在室内工作，也可以在室外工作。由于木蜡油具有良好的渗透性，一般都能渗透到木材中。如果施工环境比较干燥，那么木材就可以通过木材本身的纹孔来交换湿度，从而使木材的含水量变得更加均匀。
木材表面涂清漆时，清漆会在木材表面形成树脂膜，树脂膜可以阻止空气进入木材，但木材内部的水分不能散发，所以清漆一般不适合在潮湿的环境中操作，对施工环境的要求会更高。
3.使用效果不同：因为木蜡油透气性好，当木蜡油涂在木头表面时，木头还能自然呼吸，不容易出现开裂、翘曲等现象，同时木材本身的纹理也能保持清新自然。当木头表面涂上清漆时，清漆会在木头表面形成一层树脂膜，既防水又防潮。
4.环保性不同：在生产木蜡油的过程中，厂家使用的原料和色料一般不含化学成分，不含甲醛、苯等有害物质。因此，木蜡油无毒无害，非常环保。在清漆的生产过程中，一般都会含有甲醛、苯等有害物质，所以清漆的环保性会比较差，一般会散发出刺鼻的气味。
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